RattanID - target capture
Raw phylogenomic sequence data for the calamoid palms at species and population level. Targeted sequence capture was conducted by hybridisation of libraries to a bait cocktail of the Angiosperms353 probe kit of Johnson et al. 2018 (https://doi.org/10.1093/sysbio/syy086) and the PhyloPalm probe kit of Loiseau et al. 2019 (https://doi.org/10.3389/fpls.2019.00864).
- Calamus acamptostachys
- Calamus acanthochlamys
- Calamus acanthophyllus
- Calamus acanthospathus
- Calamus acaulis
- Calamus adspersus
- Calamus aidae
- Calamus albidus
- Calamus altiscandens
- Calamus andamanicus
- Calamus anomalus
- Calamus applanatus
- Calamus arborescens
- Calamus aruensis
- Calamus arugda
- Calamus ashtonii
- Calamus asperrimus
- Calamus asteracanthus
- Calamus ater
- Calamus australis
- Calamus axillaris
- Calamus bacularis
- Calamus badius
- Calamus baiyerensis
- Calamus balerensis
- Calamus balingensis
- Calamus banggiensis
- Calamus bankae
- Calamus baratangensis
- Calamus barbatus
- Calamus barfodii
- Calamus barisanensis
- Calamus batanensis
- Calamus beccarii
- Calamus bicolor
- Calamus billitonensis
- Calamus bimanifer
- Calamus boniensis
- Calamus bousigonii
- Calamus brandisii
- Calamus brevicaulis
- Calamus brevissimus
- Calamus brunneus
- Calamus bulubabi
- Calamus burckianus
- Calamus burkillianus
- Calamus caesius
- Calamus calapparius
- Calamus calciphilus
- Calamus calicarpus
- Calamus calospathus
- Calamus capillosus
- Calamus carsicola
- Calamus caryotoides
- Calamus castaneus
- Calamus caurinus
- Calamus centralis
- Calamus ceratophorus
- Calamus cheirophyllus
- Calamus ciliaris
- Calamus cinereus
- Calamus clivorum
- Calamus cockburnii
- Calamus compsostachys
- Calamus comptus
- Calamus concinnus
- Calamus confusus
- Calamus conirostris
- Calamus conjugatus
- Calamus conspectus
- Calamus convallium
- Calamus crassifolius
- Calamus crinitus
- Calamus crinitus su...
- Calamus crinitus su...
- Calamus crinitus su...
- Calamus cristatus
- Calamus croftii
- Calamus cumingianus
- Calamus cuthbertsonii
- Calamus dasyacanthus
- Calamus deerratus
- Calamus delicatulus
- Calamus densifloropsis
- Calamus densiflorus
- Calamus depauperatus
- Calamus dianbaiensis
- Calamus didymocarpus
- Calamus diepenhorstii
- Calamus digitatus
- Calamus dilaceratus
- Calamus dioicus
- Calamus discolor
- Calamus disjunctus
- Calamus distentus
- Calamus divaricatus
- Calamus divergens
- Calamus dongnaiensis
- Calamus dracunculus
- Calamus dumetosus
- Calamus egregius
- Calamus elegans
- Calamus erectus
- Calamus erinaceus s...
- Calamus erinaceus s...
- Calamus erioacanthus
- Calamus erythrocarpus
- Calamus essigii
- Calamus eugenei
- Calamus evansii
- Calamus exiguus
- Calamus exilis
- Calamus fertilis
- Calamus filipendulus
- Calamus filispadix
- Calamus fissilis
- Calamus flabellatus
- Calamus flagellum
- Calamus floribundus
- Calamus formicarius
- Calamus formosanus
- Calamus furvus
- Calamus gaharuensis
- Calamus gajoensis
- Calamus gamblei
- Calamus geniculatus
- Calamus gibbsianus
- Calamus glaucescens
- Calamus godefroyi
- Calamus gonospermus
- Calamus goramensis
- Calamus gracilipes
- Calamus gracilis su...
- Calamus griseus
- Calamus guruba
- Calamus hallierianus
- Calamus harmandii
- Calamus heatubunii
- Calamus helferianus
- Calamus henryanus
- Calamus heteracanth...
- Calamus heteracanthus
- Calamus heteroideus
- Calamus hirsutus su...
- Calamus hirsutus su...
- Calamus hirsutus su...
- Calamus holttumii
- Calamus hookerianus
- Calamus horrens
- Calamus hosensis
- Calamus hukaungensis
- Calamus impressus
- Calamus inermis
- Calamus ingens
- Calamus inops
- Calamus insignis
- Calamus insolitus
- Calamus insularis
- Calamus interruptus
- Calamus jacobsii
- Calamus javensis
- Calamus johanis
- Calamus johndransfi...
- Calamus johnsii
- Calamus kampucheaensis
- Calamus kandariensis
- Calamus karuensis
- Calamus katikii
- Calamus kebariensis
- Calamus kinabaluensis
- Calamus kingianus
- Calamus kjellbergii
- Calamus klossii
- Calamus kontumensis
- Calamus koordersianus
- Calamus kostermansii
- Calamus kubahensis
- Calamus kunstleri s...
- Calamus kunstleri s...
- Calamus lambirensis
- Calamus lamprolepis
- Calamus laoensis
- Calamus lateralis
- Calamus latifolius
- Calamus latus
- Calamus lauterbachii
- Calamus laxissimus
- Calamus leiocaulis
- Calamus leloi
- Calamus lengguanii
- Calamus leptopus
- Calamus leptospadix
- Calamus leptostachys
- Calamus lobatus
- Calamus lobbianus
- Calamus loherianus
- Calamus longibracte...
- Calamus longipes
- Calamus longipinna
- Calamus longisetus
- Calamus longispathus
- Calamus longiusculus
- Calamus lucysmithiae
- Calamus macrochlamys
- Calamus macropterus
- Calamus macrorhynchus
- Calamus macrosphaerion
- Calamus maculatus
- Calamus maiadum
- Calamus malawaliensis
- Calamus manan
- Calamus manglaensis
- Calamus manillensis
- Calamus marginatus
- Calamus maturbongsii
- Calamus megaphyllus
- Calamus meghalayensis
- Calamus melanacanthos
- Calamus melanochaetes
- Calamus melanochrous
- Calamus melanoloma
- Calamus melanorhynchus
- Calamus metzianus
- Calamus micracanthus
- Calamus micranthus
- Calamus microsphaerion
- Calamus minahassae
- Calamus minor
- Calamus minutus
- Calamus mirabilis
- Calamus mitis
- Calamus modestus
- Calamus mogeae
- Calamus mollispinus
- Calamus moorei
- Calamus moorhousei
- Calamus moseleyanus
- Calamus moti
- Calamus muelleri
- Calamus multispicatus
- Calamus muricatus
- Calamus myriacanthus
- Calamus myrianthus
- Calamus nanduensis
- Calamus nannostachys
- Calamus nanodendron
- Calamus nematospadix
- Calamus nicobaricus
- Calamus nielsenii
- Calamus nitidus
- Calamus notabilis
- Calamus novae georgii
- Calamus nudus
- Calamus nuichuaensis
- Calamus nuralievii
- Calamus obiensis
- Calamus oblatus
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus oblongus su...
- Calamus occidentalis
- Calamus ochrolepis
- Calamus ocreatus
- Calamus oligostachys
- Calamus optimus
- Calamus oresbiopsis
- Calamus oresbius
- Calamus ornatus
- Calamus ovoideus
- Calamus oxleyanus
- Calamus oxleyoides
- Calamus oxycarpus
- Calamus oxycoccus
- Calamus pachystemonus
- Calamus padangensis
- Calamus pahangensis
- Calamus pandanosmus
- Calamus papuanus
- Calamus parutan
- Calamus parvulus
- Calamus paspalanthus
- Calamus paulii
- Calamus pedicellaris
- Calamus pedicellatus
- Calamus penicillatus
- Calamus perakensis ...
- Calamus perakensis ...
- Calamus peregrinus
- Calamus periacanthus
- Calamus pertenuis
- Calamus pholidostachys
- Calamus pilosellus
- Calamus pilosissimus
- Calamus platyspathus
- Calamus plicatus
- Calamus poensis
- Calamus pogonacanthus
- Calamus pogonotium
- Calamus poilanei
- Calamus politus
- Calamus polycladus
- Calamus posoanus
- Calamus powlingii
- Calamus praetermissus
- Calamus propinquus
- Calamus pseudoconcolor
- Calamus pseudomollis
- Calamus pseudotenui...
- Calamus pseudotenui...
- Calamus pseudozebrinus
- Calamus psilocladus
- Calamus pycnocarpus
- Calamus pygmaeus
- Calamus quangngaiensis
- Calamus radiatus
- Calamus radicalis
- Calamus radulosus
- Calamus reinwardtii
- Calamus reticulatus
- Calamus retroflexus
- Calamus rhabdocladus
- Calamus rheedei
- Calamus rhomboideus
- Calamus rhytidomus
- Calamus ridleyanus
- Calamus robinsonianus
- Calamus rotang
- Calamus ruber
- Calamus rudentum
- Calamus rugosus
- Calamus rumphii
- Calamus ruptilis
- Calamus ruptiloides
- Calamus ruvidus
- Calamus sabalensis
- Calamus salicifolius
- Calamus saltuensis
- Calamus samian
- Calamus sandsii
- Calamus sarawakensis
- Calamus sashae
- Calamus scabridulus
- Calamus scabrispathus
- Calamus scapiger
- Calamus schistoacan...
- Calamus schlechteri...
- Calamus scipionum
- Calamus scleracanthus
- Calamus sedens
- Calamus senalingensis
- Calamus septimus
- Calamus seriatus
- Calamus seropakensis
- Calamus serpentinus
- Calamus serrulatus
- Calamus sessiliflorus
- Calamus simplex
- Calamus siphonospathus
- Calamus smitinandii
- Calamus sordidus
- Calamus spanostachys
- Calamus sparsiflorus
- Calamus spectatissimus
- Calamus spiculifer
- Calamus spinosus
- Calamus spinulinervis
- Calamus spiralis
- Calamus suaveolens
- Calamus subangulatus
- Calamus subsolanus
- Calamus sulawesiensis
- Calamus sumatranus
- Calamus superciliatus
- Calamus susukensis
- Calamus symphysipus
- Calamus tadulakoensis
- Calamus tambingensis
- Calamus tapanensis
- Calamus temii
- Calamus tenompokensis
- Calamus tenuis
- Calamus tetradactyl...
- Calamus tetradactylus
- Calamus thwaitesii
- Calamus thysanolepis
- Calamus trachycoleus
- Calamus trigynus
- Calamus tumidus
- Calamus unifarius
- Calamus unijugus
- Calamus ursinus
- Calamus usitatus
- Calamus validus
- Calamus vattayila
- Calamus velutinus
- Calamus verticillaris
- Calamus vestitus
- Calamus vidalianus
- Calamus viminalis
- Calamus vinaceus
- Calamus vinosus
- Calamus viridis
- Calamus vitiensis
- Calamus walkeri
- Calamus wanggaii
- Calamus warayanus
- Calamus warburgii
- Calamus wedaensis
- Calamus whitmorei
- Calamus wightii
- Calamus womersleyi
- Calamus wuliangshan...
- Calamus yentuensis
- Calamus zebrinus
- Calamus zeylanicus
- Calamus zieckii
- Calamus zollingeri ...
- Calamus zollingeri ...
- Calamus zollingeri ...
- Calamus zonatus sub...
- Calamus zonatus sub...
- ELIXIR ENA
- Eremospatha barendii
- Eremospatha dransfi...
- Eremospatha haullev...
- Eremospatha hookeri
- Eremospatha laurentii
- Eremospatha macrocarpa
- Eremospatha quinque...
- Eremospatha tessman...
- Eremospatha wendlan...
- Eugeissona ambigua
- Eugeissona brachyst...
- Eugeissona insignis
- Eugeissona minor
- Eugeissona utilis
- Korthalsia angustif...
- Korthalsia bejaudii
- Korthalsia brassii
- Korthalsia celebica
- Korthalsia cheb
- Korthalsia concolor
- Korthalsia debilis
- Korthalsia echinometra
- Korthalsia ferox
- Korthalsia flagellaris
- Korthalsia furcata
- Korthalsia furtadoana
- Korthalsia hispida
- Korthalsia jala
- Korthalsia junghuhnii
- Korthalsia laciniosa
- Korthalsia lanceolata
- Korthalsia merrillii
- Korthalsia minor
- Korthalsia paucijuga
- Korthalsia rigida
- Korthalsia robusta
- Korthalsia rogersii
- Korthalsia rostrata
- Korthalsia scaphige...
- Korthalsia scortech...
- Korthalsia tenuissima
- Korthalsia zippelii
- Laccosperma acutifl...
- Laccosperma korupense
- Laccosperma laeve
- Laccosperma robustum
- Laccosperma secundi...
- Mauritia carana
- Mauritiella aculeata
- Mauritiella armata
- Mauritiella macroclada
- Mauritiella pumila
- Metroxylon amicarum
- Metroxylon paulcoxii
- Metroxylon salomonense
- Metroxylon upoluense
- Metroxylon vitiense
- Metroxylon warburgii
- Myrialepis paradoxa
- Oncocalamus macrosp...
- Oncocalamus mannii
- Oncocalamus tuleyi
- Oncocalamus wrighti...
- Pigafetta elata
- Plectocomia assamica
- Plectocomia billito...
- Plectocomia bractealis
- Plectocomia dransfi...
- Plectocomia elmeri
- Plectocomia elongata
- Plectocomia elongat...
- Plectocomia himalayana
- Plectocomia khasyana
- Plectocomia longist...
- Plectocomia lorzingii
- Plectocomia macrost...
- Plectocomia microst...
- Plectocomia mulleri
- Plectocomia pierreana
- Plectocomia pygmaea
- Plectocomiinae sp B...
- Plectocomiopsis cor...
- Plectocomiopsis gem...
- Plectocomiopsis mira
- Plectocomiopsis son...
- Plectocomiopsis tri...
- Plectocomiopsis wrayi
- Raphia africana
- Raphia australis
- Raphia farinifera
- Raphia gentiliana
- Raphia hookeri
- Raphia laurentii
- Raphia longiflora
- Raphia mannii
- Raphia monbuttorum
- Raphia palma pinus
- Raphia regalis
- Raphia rostrata
- Raphia ruwenzorica
- Raphia sese
- Raphia sudanica
- Raphia taedigera
- Raphia textilis
- Raphia vinifera
- RattanID target cap...
- Salacca acehensis
- Salacca affinis
- Salacca clemensiana
- Salacca dolicholepis
- Salacca dransfieldiana
- Salacca flabellata
- Salacca glabrescens
- Salacca graciliflora
- Salacca griffithii
- Salacca lophospatha
- Salacca magnifica
- Salacca minuta
- Salacca multiflora
- Salacca ramosiana
- Salacca rupicola
- Salacca sarawakensis
- Salacca secunda
- Salacca stolonifera
- Salacca sumatrana
- Salacca vermicularis
- Salacca wallichiana
- Salacca zalacca
Provenance | |
---|---|
Instrument | HiSeq X Ten; ILLUMINA |
Publisher | Blue-Cloud Data Discovery & Access service; ELIXIR-ENA |
Publication Year | 2024 |
OpenAccess | true |
Contact | blue-cloud-support(at)maris.nl |
Representation | |
---|---|
Discipline | Marine Science |
Temporal Coverage Begin | 2023-04-20T00:00:00Z |
Temporal Coverage End | 2023-04-24T00:00:00Z |