Major food bacterial pathogens in the united states and around the world, including Salmonella enterica, E. coli, Shigella, Listeria monocytogenes, Campylobacter Jejuni, and Vibrio parahaemolyticus genome sequencing
University of California at Davis 100K Pathogen Genome Project. Major bacterial pathogens in the United States and around the world, including Salmonella enterica, E. coli, Shigella, Listeria monocytogenes, Campylobacter Jejuni, Vibrio parahaemolyticus. This project also contains WGS from many food-associated organisms that have unique traits.
- 12
- 12 b
- 12 d
- 12 i
- 12 l
- 12 r
- 14
- 14 a e
- 14 g
- 22 z29 enx
- 25 z10 1
- 40 g
- 40 z4
- 7 c 1
- 7 k
- 7 lw
- Bacillus velezensis
- Bacteria
- Campylobacter
- Campylobacter coli
- Campylobacter jejuni
- Campylobacter jejun...
- Campylobacter lari
- Campylobacter sp 1
- Campylobacter sp 107
- Campylobacter sp 108
- Campylobacter sp 109
- Campylobacter sp 110
- Campylobacter sp 111
- Campylobacter sp 112
- Campylobacter sp 113
- Campylobacter sp 114
- Campylobacter sp 3
- Campylobacter sp 4
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
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- Campylobacter sp BC...
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- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Campylobacter sp BC...
- Clostridioides diff...
- Clostridium paraput...
- Corynebacterium sp ...
- ELIXIR ENA
- Enterobacter
- Enterococcus
- Enterococcus faecalis
- Escherichia coli
- Helicobacter
- Helicobacter pylori
- Helicobacter pylori...
- Hungatella hathewayi
- Kosakonia cowanii
- Listeria monocytogenes
- Listeria seeligeri
- Pseudomonas aeruginosa
- Pseudomonas soli
- Salmonella bongori
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella bongori ...
- Salmonella enterica
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
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- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Salmonella enterica...
- Shigella boydii
- Shigella dysenteriae
- Shigella flexneri
- Shigella sonnei
- Staphylococcus
- Staphylococcus aureus
- Staphylococcus delp...
- Vibrio parahaemolyt...
- Vibrio parahaemolyt...
- Vibrio parahaemolyt...
- Vibrio vulnificus
- food metagenome
- food production met...
- m p
- s 1
- t z6
- v 1
- z13
- z15
- z23
- z24
- z24 z39
- z28
- z28 z6
- z32
- z51
Provenance | |
---|---|
Instrument | Illumina HiSeq 2500; PacBio RS; Illumina MiSeq; HiSeq X Ten; Illumina HiSeq 4000; Ion Torrent Proton; Illumina HiSeq 3000; Illumina HiSeq 2000; PacBio RS II; ION_TORRENT; ILLUMINA; PACBIO_SMRT |
Publisher | Blue-Cloud Data Discovery & Access service; ELIXIR-ENA |
Contributor | University of California at Davis |
Publication Year | 2024 |
OpenAccess | true |
Contact | blue-cloud-support(at)maris.nl |
Representation | |
---|---|
Discipline | Marine Science |
Spatial Coverage | (-99.128W, -33.870S, 151.260E, 19.428N) |
Temporal Coverage Begin | 1953-01-01T00:00:00Z |
Temporal Coverage End | 2019-03-01T00:00:00Z |